Zakład Embriologii
Wydział Lekarski

Zakład Anatomii Klinicznej
Wydział Lekarski

W ramach programu “Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza” oferujemy współpracę i możliwość wykonania wybranych badań naukowych dotyczących m.in. analiz cytometrycznych, badań z wykorzystaniem platformy Luminex, druku 3D.

Badania wykonywane są w Zakładzie Embriologii oraz Anatomii Klinicznej.

Wykonujemy analizy zgodnie z indywidualnymi zleceniami z dostosowaniem do konkretnych potrzeb. Koszt analiz wyceniany jest indywidualnie.

Główna aparatura badawcza i metody badawcze

Drukarka 3D – możliwość tworzenia struktur 3D na bazie żeli, biomateriałów, komórek, tworzenie organoidów do badań cytotoksyczności, badań molekularnych, optymalizacja tworzenia modeli komórkowych.

Cytometr przepływowy – analizy immonofenotypowe komórek, badania żywotności komórek, analizy nanomateriałów, wybrane badania aktywności komórek. Więcej na temat aparatu>>>

Cytometr przepływowy CytoFLEX umożliwia weryfikację wielu parametrów (max. 13 ) w pojedynczej próbce. Analiza cytometryczna pozwala na ocenę aktywności różnego rodzaju komórek hodowanych in vitro lub pozyskiwanych od pacjentów. Przykłady badań i oceny: • odsetka komórek dzielących się (test Edu – alternatywa dla BrdU), • odsetka ulegających apoptozie (aktywacja kaspaz i eksternalizacja aneksyny), • żywotności komórek ( barwienie PI, DAPI, kalceina), • cyklu komórkowego (zawartości DNA) czy • określenie wielkości i ziarnistości komórek.

Ponadto można prześledzić zmiany zachodzące pod wpływem czynnika/związku/ zastosowanych warunków poprzez sprawdzenie wystąpienia m.in. • reakcji alergicznej (aktywacji bazofili z wykorzystaniem krwi pełnej) • aktywacji układu immunologicznego (analiza komórek PBMCs wyizolowanych z krwi pacjenta) • żywotności komórek (odsetka żywych/martwych) Cytometria pozwala także na: • potwierdzenie immunofenotypu komórek (zestawu markerów powierzchniowych charakterystycznych np. dla komórek macierzystych, komórek śródbłonka itp.) czy • nanoanalizę niewielkich cząstek (np. egzosomów).

Luminex – platforma umożliwiająca analizę w pojedynczej próbce wielu analitów, np. białek, cytokin

Metoda pozwala na analizę wielu cytokin, czynników wzrostu, enzymów w jednej próbce roztworu (min. 50 uL), np. osocza, surowicy, pożywki hodowanej (badamy aktywność komórek in vitro) lub innych płynów. Metoda opiera się detekcji czynników przy pomocy sprzężonych z fluorochromem przeciwciał monoklonalnych. Przykłady oznaczanych analitów: IL-6, TNFα, IL-1β, IFNɣ, IL-8, IL-10, IL-4, MCP-1, przeciwciała Anti-SSA/Ro52, Anti-SSA/Ro60, Anti-SSB/La, Anti-C1q, składniki dopełniacza C1q, C3b, C2, C5a, C5, C4b Inhibitory TIMP, enzymy MMP, inne markery zapalenia/sepsy MIF, sFasL, sFas/TNFRSF6, PAI-1 (total), sICAM.

Przykłady możliwości analiz>>>

Laboratorium hodowli komórkowych

W ramach usług IDUB oferujemy również izolowanie i hodowle komórek pierwotnych pochodzących od pacjentów (głównie z tkanki tłuszczowej i skóry) oraz unieśmiertelnionych linii komórkowych. Pracowania posiada m.in. komory laminarne oraz inkubatory CO2 przeznaczone do długotrwałych hodowli komórek. Możliwe jest testowanie i analizy biologiczne nowych związków chemicznych, potencjalnych leków (profil regeneracyjny, p/nowotworowy, immunomodulacyjny). Pracownia zajmuje się również oceną histologiczną tkanek (bloczki parafinowe, tkanki zamrożone, barwienia histologiczne).

Laboratorium hodowli komórkowych - Zakład Embriologii

Kriostat - Zakład Anatomii Klinicznej

Laboratorium analiz komórkowych - Zakład Embriologii

PUBLIKACJE

1. Adrian Kobiela, Lilit Hovhannisyan, Paulina Jurkowska, Jorge Bernardino de la Serna, Aleksandra Bogucka, Milena Deptuła, Argho Aninda Paul, Kinga Panek, Ewa Czechowska, Michał Rychłowski, Aleksandra Królicka, Jacek Zieliński, Susanne Gabrielsson, Michał Pikuła, Magdalena Trzeciak, Graham S Ogg, Danuta Gutowska-Owsiak Excess filaggrin in keratinocytes is removed by extracellular vesicles to prevent premature death and this mechanism can be hijacked by Staphylococcus aureus in a TLR2-dependent fashion Extracell Vesicles 2023 Jun;12(6):e12335. doi: 10.1002/jev2.12335. Więcej informacji tutaj: https://gumed.edu.pl/75367.html

2. Dzierżyńska M., Sawicka J., Deptuła M., Sosnowski P., Sass P., Peplińska B., Pietralik-Molińska Z., Fularczyk M., Kasprzykowski F., Zieliński J., Kozak M., Sachadyn P., Pikuła M., Rodziewicz-Motowidło S. Release systems based on self-assembling RADA16-I hydrogels with a signal sequence which improves wound healing processes. Sci Rep. 2023 Apr 18;13(1):6273. doi: 10.1038/s41598-023-33464-w. PMID: 37072464.

3. Katarzyna Czerwiec, Małgorzata Zawrzykraj, Milena Deptuła, Aneta Skoniecka, Agata Tymińska, Jacek Zieliński, Adam Kosiński, Michał Pikuła Adipose-Derived Mesenchymal Stromal Cells in Basic Research and Clinical Applications. Int J Mol Sci 2023 Feb 15; 24(4):3888. doi: 10.3390/ijms24043888.

2022 r.

1. Katarzyna Kuncewicz, Claire Battin, Katarzyna Węgrzyn, Adam Sieradzan, Anna Wardowska, Emilia Sikorska, Irma Giedrojć, Pamela Smardz, Michał Pikuła, Peter Steinberger, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Marta Spodzieja, Targeting the HVEM protein using a fragment of glycoprotein D to inhibit formation of the BTLA/HVEM complex. Bioorg Chem. 2022 May;122:105748. doi: 10.1016/j.bioorg.2022.105748. Epub 2022 Mar 19.

2. Paweł Sosnowski, Piotr Sass, Paulina Słonimska, Rafał Płatek, Jolanta Kamińska, Jakub Baczyński Keller, Piotr Mucha, Grażyna Peszyńska-Sularz, Artur Czupryn, Michał Pikuła, Arkadiusz Piotrowski, Łukasz Janus, Sylwia Rodziewicz-Motowidło, Piotr Skowron, Paweł Sachadyn, Regenerative Drug Discovery Using Ear Pinna Punch Wound Model in Mice. Pharmaceuticals (Basel). 2022 May 16;15(5):610. doi: 10.3390/ph15050610.

3. Adrian Kobiela, Joanna E Frackowiak, Anna Biernacka, Lilit Hovhannisyan, Aleksandra E Bogucka, Kinga Panek, Argho Aninda Paul, Joanna Lukomska, Xinwen Wang, Eleni Giannoulatou, Aleksandra Krolicka, Jacek Zielinski, Milena Deptula, Michal Pikula, Susanne Gabrielsson, Graham S Ogg, Danuta Gutowska-Owsiak, Exposure of Keratinocytes to Candida Albicans in the Context of Atopic Milieu Induces Changes in the Surface Glycosylation Pattern of Small Extracellular Vesicles to Enhance Their Propensity to Interact With Inhibitory Siglec Receptors. Front Immunol. 2022 Jun 9;13:884530. doi: 10.3389/fimmu.2022.884530. eCollection 2022.

2021 r.

1. Kosikowska-Adamus P., Sikorska E., Wyrzykowski D., Walewska A., Golda A., Deptuła M., Obuchowski M., Prahl A., Pikuła M., Lesner A. 2021. Lipidation of Temporin-1CEb Derivatives as a Tool for Activity Improvement, Pros and Cons of the Approach. Int. J. Mol. Sci. 22, no. 13: 6679. doi.org/10.3390/ijms22136679.

2. Deptuła M., Brzezicka A., Skoniecka A., Zieliński J., Pikuła M., Adipose-derived stromal cells for nonhealing wounds: Emerging opportunities and challenges Medicinal Research Reviews 2021 Jul; 41(4):2130-2171 doi: 10.1002/med.21789 Więcej na temat artykułu Tutaj>>>>

3. Sawicka J., Iłowska E., Deptuła M., Sosnowski P., Sass P., Czerwiec K., Chmielewska K., Szymańska A., Pietralik-Molińska Z., Kozak M., Sachadyn P., Pikuła M., Rodziewicz-Motowidło S., *Functionalized Peptide Fibrils as a Scaffold for Active Substances in Wound Healing. Int J Mol Sci. 2021; 22(8): 3818. doi: 10.3390/ijms22083818.

4. Mazuryk J., Puchalska I., Koziński K., Ślusarz M.J., Ruczyński J., Rekowski P., Rogujski P., Płatek R., Wiśniewska M.B., Piotrowski A., Janus Ł., Skowron P.M., Pikuła M., Sachadyn P., Rodziewicz-Motowidło S., Czupryn A., Mucha P. PTD4 Peptide Increases Neural Viability in an In Vitro Model of Acute Ischemic Stroke. Int J Mol Sci. 2021; 22(11):6086.

5. Skoniecka A., Cichorek M., Tyminska A., Pelikant-Malecka I., Dziewiątkowski J., Melanization as unfavorable factor in amelanotic melanoma cell biology Protoplasma 2021 Jan 27.

6.Cichorek M, Kowiański P, Lietzau G, Lasek J, Moryś J. 2021. Neuroglia – development and role in physiological and pathophysiological processes Folia Morphol (Warsz). 2021;80(4):766-775. 10.5603/FM.a2021.0109.

2020 r.

1. Małuch I., Stachurski O., Kosikowska-Adamus P., Makowska M., Bauer M., Wyrzykowski D., Hać A., Kamysz W., Deptuła M., Pikuła M., Sikorska E., Double-Headed Cationic Lipopeptides: An Emerging Class of Antimicrobials. Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 8944.

2. Kuncewicz K., Battin C., Sieradzan A., Karczyńska A., Orlikowska M., Wardowska A., Pikuła M., Steinberger P., Rodziewicz-Motowidło S., Spodzieja M., Fragments of gD Protein as Inhibitors of BTLA/HVEM Complex Formation – Design, Synthesis, and Cellular Studies. Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 8876.

3. Cichorek M., Ronowska A., Dzierzbicka K., Gensicka-Kowalewska M., Deptuła M., Pelikant-Maleckade I., Chloroacridine derivatives as potential anticancer agents which may act as tricarboxylic acid cycle enzyme inhibitors. Biomedicine & Pharmacotherapy Vol. 130, October 2020, 110515

4. Golab K., Krzystyniak A., Langa P., Pikuła M., Kunovac S, Borek P., Trzonkowski P., Millis J.M., Fung J., Witkowski P., Effect of serum on SmartFlare™ RNA Probes uptake and detection in cultured human cells. Biomed J Sci Tech Res. 2020; 28(4): 21788-21793.

5. Biernat M., Ciołek L., Dzierżyńska M., Oziębło A., Sawicka J., Deptuła M., Bauer M., Kamysz W., Pikuła M., Jaegermann Z., Rodziewicz‐Motowidło S., Porous chitosan/ZnO‐doped bioglass composites as carriers of bioactive peptides. Int J Appl Ceram Technol. 2020;17: 2807-2816.

6. Wardowska A., Smoleńska Ż., Lisowska K.A., Zdrojewski Z., Pikuła M.,Dendritic cells’ characteristics in patients with treated systemic lupus erythematosus. Acta Biochim Pol. 2020 Jul 30;67(3): 417-429. doi: 10.18388/abp.2020_5416.

7. Sawicka J., Dzierżyńska M., Wardowska A., Deptuła M., Rogujski P., Sosnowski P., Filipowicz N., Mieczkowska A., Sass P., Pawlik A., Hać A., Schumacher A., Gucwa M., Karska, N., Kamińska J., Płatek R., Mazuryk J., Zieliński J., Kondej K., Młynarz P., Mucha P., Skowron P., Janus Ł., Herman-Antosiewicz A., Sachadyn P., Czupryn A., Piotrowski A., Pikuła M., Rodziewicz-Motowidło S., Imunofan—RDKVYR Peptide—Stimulates Skin Cell Proliferation and Promotes Tissue Repair. Molecules 2020, 25, 2884.

8. Wardowska A., Komorniczak M., Skoniecka A., Bułło-Piontecka B., Lisowska K.A., Dębska-Ślizień M.A., Pikuła M., Alterations in peripheral blood B cells in systemic lupus erythematosus patients with renal insufficiency. Int Immunopharmacol. 2020 Apr 1;83:106451.

9. Siebert A., Deptuła M., Cichorek M., Ronowska A., Cholewiński G., Rachon J., Anticancer Properties of Amino Acid and Peptide Derivatives of Mycophenolic Acid. Anti-Cancer Agents in Med. Chem. 2020 May

10. Wardowska A. The epigenetic face of lupus: Focus on antigen-presenting cells Int Immunopharmacol 2020 Apr;81:106262;

11. Skowron P.M., Krawczun N., Zebrowska J., Krefft D., Zolnierkiewicz O., Bielawa M., Jezewska-Frackowiak J., Janus L., Witkowska M., Palczewska M., Schumacher A., Wardowska A., Deptula M., Czupryn A., Mucha P., Piotrowski P., Sachadyn P., Rodziewicz-Motowidlo S., Pikula M., Zylicz-Stachula A. A vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins for novel biomaterials, biomedical and industrial applications. Materials Science and Engineering: C. Vol. 108, March 2020, 110426

12. Skowron P.M., Krawczun N., Zebrowska J., Krefft D., Zolnierkiewicz O., Bielawa M., Jezewska-Frackowiak J., Janus L., Witkowska M., Palczewska M., Schumacher A., Wardowska A., Deptula M., Czupryn A., Mucha P., Piotrowski P., Sachadyn P., Rodziewicz-Motowidlo S., Pikuła M., Zylicz-Stachula A., Data regarding a new, vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for the construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins as well as biological effects of selected polypeptides obtained this method. Data in Brief, 2019 Dec 31;28:105069. doi: 10.1016/j.dib.2019.105069. eCollection 2020 Feb.

13. Zieliński J., Jaworski R., Pikuła M., Jaśkiewicz J., Girnyi S., Pałubicka A., But M. The Influence of Pre-Operative Chemo- and Radiotherapy in Patients with Colon Cancer on Wound Healing in the Material from a Single Center. European Journal of Surgical Oncology, Feb 2020, vol. 46, nr 2, s. e109

14. Deptuła M., Karpowicz P., Wardowska A., Sass P., Sosnowski P., Mieczkowska A., Filipowicz N., Dzierżyńska M., Sawicka J., Nowicka E., Langa P., Schumacher A., Cichorek M., Zieliński J., Kondej K., Kasprzykowski F., Czupryn A., Janus Ł., Mucha P., Skowron P., Piotrowski A., Sachadyn P., Rodziewicz-Motowidło S., Pikuła M. , Development of a Peptide Derived from Platelet-Derived Growth Factor (PDGF-BB) into a Potential Drug Candidate for the Treatment of Wounds. Advances in Wound Care. 2020 Dec;9(12): 657-675. doi: 10.1089/wound.2019.1051.

2019 r.


1. Sass P. , Sosnowski P., Podolak-Popinigis J., Górnikiewicz B., Kamińska J., Deptuła M., Nowicka E., Wardowska A., Ruczyński J., Rekowski P., Rogujski P., Filipowicz N., Mieczkowska A., Peszyńska-Sularz G., Janus Ł., Skowron P., Czupryn A., Mucha P., Piotrowski A., Rodziewicz-Motowidło S., Pikuła M., Sachadyn P. Epigenetic inhibitor zebularine activates ear pinna wound closure in the mouse. EBioMedicine. 2019; 46: 317-329 Więcej na temat artykułu Tutaj>>>>

2. Wardowska A., Komorniczak M., Bułło-Piontecka B., Dębska-Ślizień A., Pikuła M. *Transcriptomic and epigenetic alterations in dendritic cells correspond with chronic kidney disease in lupus nephritis. Front. Immunol. 2019; 10: 2026. doi: 10.3389/fimmu.2019.02026

3. Palubicka A., Jaworski R., Wekwejt M., Swieczko-Zurek B., Pikula M., Jaskiewicz J., Zielinski J. Surgical Site Infection after Breast Surgery: A Retrospective Analysis of 5-Year Postoperative Data from a Single Center in Poland. Medicina. 2019; 55(9): 512.

4. Specjalski K., Maciejewska E., Pawłowski R., Zieliński M., Trzonkowski P., Pikuła M., Jassem E. Changing microRNA Expression during Three-Month Wasp Venom Immunotherapy. Immunol Invest. 2019; 24: 1-9.

5. Deptuła M., Zieliński J., Wardowska A., Pikuła M. Wound healing complications in oncological patients: perspectives for cellular therapy. Adv Dermatol Allergol. 2019; 36(2): 139-146.

6. Girnyi S., Serkies K., Jaworski R., But M., Wiski A., Komornicka J., Pikuła M., Zieliński J. Skin giant neoplastic ulcers – treatment options and clinical challenges. Nowotwory. Journal of Oncology 2019; 69(1): 12-17.

7. Krzystyniak A., Baczynska E., Magnowska M., Antoniuk S., Roszkowska M., Zareba-Koziol M., Das N., Basu S., Pikuła M., Wlodarczyk J. Prophylactic Ketamine Treatment Promotes Resilience to Chronic Stress and Accelerates Recovery: Correlation with Changes in Synaptic Plasticity in the CA3 Subregion of the Hippocampus. Int J Mol Sci. 2019; 8; 20(7)

8. Kamińska J., Kamińska J., Langa P., Deptuła M., Zieliński J., Sachadyn P., Wardowska A., Pikuła M. Transcriptional activity of epigenetic remodelling genes declines in keratinocytes after in vitro Expansion. Adv Med Sci. 2019; 64: 274-279.

2018 r.

1. Brzezicka A., Kondej K., Błażyńska-Spychalska A., Spychalski P., Jankau J., Pikuła M. Zastosowanie komórek macierzystych tkanki tłuszczowej w medycynie – najnowsze trendy. Chirurgia Plastyczna i Oparzenia. 2018; 6(3): 79-85.

2. Gójska-Grymajło A., Zieliński M., Wardowska A., Gąsecki D., Pikuła M., Karaszewski B. CXCR7+ and CXCR4+ stem cells and neuron specific enolase in acute ischemic stroke patients. Neurochem Int. 2018; 120: 134-139

3. Mieczkowska A., Schumacher A., Filipowicz N., Wardowska A., Zieliński M., Madanecki P., Nowicka E., Langa P., Deptuła M., Zieliński J., Kondej K., Renkielska A., Buckley P.G., Crossman D.K., Crowley M.R., Czupryn A., Mucha P., Sachadyn P., Janus Ł., Skowron P., Rodziewicz-Motowidło S., Cichorek M., Pikuła M., Piotrowski A. Immunophenotyping and transcriptional profiling of in vitro cultured human adipose tissue derived stem cells. Sci Rep. 2018; 27,8(1):11339 Więcej na temat artykułu Tutaj>>>>

4. Schumacher A., Cichorek M., Pikuła M.Komórki macierzyste tkanki tłuszczowej w inżynierii tkankowej i terapii trudno gojących się ran* [Adipose-derived stem cells for tissue engineering and therapy of non-healing wounds]. Postepy Hig i Med. Dośw. 2018; 72: 806-821

5. Deptuła M., Wardowska A., Dzierżyńska M., Rodziewicz-Motowidło S., Pikuła M. Antibacterial Peptides in Dermatology–Strategies for Evaluation of Allergic Potential. Molecules. 2018; 23(2), 414; doi:10.3390/molecules23020414

6. Mucha P., Pieszko M., Miszka A., Ruczyński J., Rekowski P., Załuska I., Kozłowska A., Schumacher A., Deptuła M., Pikuła M. Ru(II)-mediated synthesis and bioactivity evaluation of 1,4,5-trisubstituted N-phthalimido protected 5-bromo-1,2,3-triazolic amino acid. Lett Org Chem. 2018; 15(4): 282-289.

KONTAKT

Prof. Michał Pikuła

Prof. dr hab. Michał Pikuła

Zastępca Dyrektora Pierwszej Szkoły Doktorskiej GUMed
Pracownia Inżynierii Tkankowej i Medycyny Regeneracyjnej

Zakład Embriologii, Wydział Lekarski
Gdański Uniwersytet Medyczny
ul. Dębinki 1, budynek Collegium Biomedicum, 80-211 Gdańsk
tel. 58 349-13-68, 58 349-14-97

E-mail: pikula@gumed.edu.pl
ORCID: 0000-0001-7751-9781